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http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/17363
2024-03-29T06:59:38ZEvaluación del estado de metilación del complejo mayor de histocompatibilidad clase 1, C (HLA-C) y su posible correlación con el estado nutricional de madres e infantes Kichwa en Ecuador.
http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/25305
Título: Evaluación del estado de metilación del complejo mayor de histocompatibilidad clase 1, C (HLA-C) y su posible correlación con el estado nutricional de madres e infantes Kichwa en Ecuador.
Autor: Velastegui Peñafiel, Erick Gonzalo
Director: Orellana Manzano, Andrea Katherine
Resumen: Epigenetic alterations have been shown to have a high impact on the health and development of an individual, in this article we analyze for the first time the levels and patterns of methylation of exon 1 of HLA-C in Kichwa population of Ecuador, using saliva samples obtained at 2 times in an interval of 8 months and sequenced with nanopore technology. We found that there is no significant difference in the percentages of methylation in exon 1 of HLA-C of mothers and children after l8 months of lactation and life respectively, however, we found that infants tend to increase their methylation level in the first 2 years of life while mothers tend to decrease it after the first 2 years of lactation. When comparing methylation levels between mothers and infants we found that at T1 there is significant difference (p-value: 0.0148) as mothers have on average X̅= 2.06% and infants X̅=1.57% while for T2 this difference is not maintained. We also identified that along the 122bp comprising exon 1 of HLA-C, cytosines 32-33, 43-44 & 96-97 retain methylation patterns in time and inheritance. Finally, we found that there is a correlation between vitamin D deficiency and increased methylation in infants, for the other variables no correlation was found between nutritional status and HLA-C exon 1 methylation levels.
Descripción: Las alteraciones epigenéticas han demostrado tener un alto impacto en la salud y el desarrollo de un individuo, en este artículo analizamos por primera vez los niveles y patrones de metilación del exón 1 de HLA-C en población Kichwa de Ecuador, mediante muestras de saliva obtenidas en 2 tiempos en un intervalo de 8 meses y secuenciadas con tecnología nanopore. Encontramos que no existe diferencia significativa en los porcentajes de metilación en el exón 1 de HLA-C de madres e hijos tras l8 meses de lactancia y vida respectivamente, sin embargo, encontramos que los infantes tienden a aumentar su nivel de metilaión en los 2 primeros años de vida mientras que las madres tienden a disminuirlo tras los 2 primeros años de lactancia. Al comparar los niveles de metilación entre madres e infantes encontramos que en T1 existe diferencia significativa (p-value: 0,0148) pues las madres tienen en promedio X̅= 2,06% y los infantes X̅=1,57% mientras para T2 no se mantiene esta diferencia. También identificamos que a lo largo de los 122pb que comprenden el exón 1 de HLA-C, las citosinas 32-33, 43-44 & 96-97 conservan los patrones de metilación en tiempo y herencia. Por último, encontramos que existe una correlación entre la deficiencia de vitamina D y el aumento de metilación en infantes, para las demás variables no se encontró correlación entre el estado nutricional y los niveles de metilación del exón 1 de HLA-C.2024-02-01T00:00:00ZIdentificación de la biodiversidad durante la fermentación de cacao (Theobroma cacao L.) de la variedad “Nacional” en fermentadores tipo hexagonal, en la ciudad de Archidona.
http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/22161
Título: Identificación de la biodiversidad durante la fermentación de cacao (Theobroma cacao L.) de la variedad “Nacional” en fermentadores tipo hexagonal, en la ciudad de Archidona.
Autor: Guerra Piedra, Luis Santiago
Resumen: Cocoa beans fermentation is one of the principal processes, related to the organoleptic
characteristics, even more, in the final quality of chocolate. In Ecuador, cocoa is the major
exportation product, especially Nacional variety. However, the fermentation process depends on the
traditional techniques of each farm, whereby the aroma and taste are very variable. The present
study aimed to describe the microbial diversity present during the time of fermentation with the
use of two types of hexagonal fermenters, in order to improve the development of microorganisms
which will help to improve the final organoleptic characteristics of beans. The cocoa beans were
fermented for 96 hours and the samples were taken at different times of the fermentation.
Posteriorly, the samples were cultivated in PCA media, for later, perform the extraction and
sequencing of microbial DNA The fermenters were compared with a DBCA taking 95% confidence.
This work found that there are no significant effects on the type of fermenter. While, with respect
to the taxonomic identification among the representative genus are Issatchenkia for yeast,
Acetobacter for acetic acid bacteria, Tatumella and Lactobacillus for lactic acid bacteria.
Descripción: La fermentación de las almendras del cacao es uno de los principales procesos, relacionados con las
características organolépticas, más aún, en las cualidades del chocolate. En Ecuador, el cacao es un
importante producto de exportación, en especial la variedad Nacional. Sin embargo, el proceso de
fermentación depende de las técnicas tradicionales de cada finca, por lo cual el aroma y el sabor son
muy variables. El presente estudio tiene como objetivo describir la diversidad microbiana presente
durante el tiempo de fermentación del cacao con el uso de dos tipos de fermentadores hexagonales,
con el fin de mejorar el desarrollo de los microorganismos los cuales ayudaran a mejorar las
características organolépticas finales de las almendras. Los granos de cacao se fermentaron
durante 96 horas y las muestras se tomaron en diferentes momentos de la fermentación.
Posteriormente, las muestras se cultivaron en medio PCA, para después, realizar la extracción y
secuenciación de ADN microbiano. Los fermentadores se compararon con un DBCA tomando un
95% de confianza. En este trabajo, se encontró que no tiene efectos significativos sobre el tipo de
fermentador. Mientras que, con respecto a la identificación taxonómica entre los géneros
representativos están Issatchenkia para levaduras, Acetobacter para bacterias ácido acéticas y
Tatumella y Lactobacillus para bacterias ácido lácticas.2022-02-11T00:00:00ZExtracción asistida por enzimas de compuestos fenólicos a partir de cáscara de mango Mangifera indica var. Tommy Atkins.
http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/22000
Título: Extracción asistida por enzimas de compuestos fenólicos a partir de cáscara de mango Mangifera indica var. Tommy Atkins.
Autor: Bonilla Rodríguez, Anahí Belén
Resumen: The conventional extraction of bioactive compounds shows low yields, this has motivated the
development of more efficient methods. The objective of this investigation was to evaluate the use of
enzymes in the extraction of phenolic compounds from mango peel Mangifera indica var. Tommy
Atkins. This article describes the effect of extraction parameters on the total phenolic content
(TPC). The application of pectinase and cellulase: pectinase (1:1, m/m) increased the CFT by 53 %
and 46 %, respectively. The factors temperature and time were significant (p < 0,05) in the
pectinase-assisted extraction, as well as the interaction of temperature and time and temperature
and pH. In the profile of phenolic compounds, a significantly higher content (p < 0,05) of gallic acid
was observed when we applied pectinase-assisted extraction. Regarding the bioactive properties, the
use of pectinase in the extraction process increased approximately 70 % the in vitro antioxidant
capacity determined by ABTS assay. No antimicrobial activity was observed against Escherichia
coli and Staphylococcus aureus. The results suggest that EAE makes it possible to obtain extracts
with applicability for industry, mainly as antioxidants.
Descripción: La extracción convencional de compuestos bioactivos presenta bajos rendimientos,
esto ha motivado el desarrollo de métodos más eficientes. El objetivo de esta
investigación fue evaluar el uso de enzimas en la extracción de compuestos
fenólicos a partir de cáscara de mango Mangifera indica var. Tommy Atkins. En
este trabajo se muestra el efecto de parámetros de extracción en el contenido
fenólico total (CFT). La aplicación de pectinasa y celulasa:pectinasa (1:1, m/m)
incrementó el CFT en un 53 % y 46 %, respectivamente. Los factores temperatura
y tiempo fueron significativos (p < 0,05) en la extracción asistida por pectinasa, así
como las interacciones entre la temperatura y tiempo, y entre temperatura y pH.
En el perfil de compuestos fenólicos, se observó un contenido significativamente
mayor (p < 0,05) de ácido gálico al aplicar la extracción asistida por pectinasa. En
cuanto a las propiedades antioxidantes, el uso de pectinasa en el proceso de
extracción incrementó aproximadamente un 70 % en la capacidad antioxidante in
vitro determinada mediante ensayo ABTS. No se observó actividad antimicrobiana
frente a Escherichia coli y Staphylococcus aureus. Los resultados sugieren que la
EAE permite obtener extractos con aplicabilidad para la industria, principalmente
como antioxidantes.2021-12-27T00:00:00ZInferencia de secuencias codificantes de enzimas proteolíticas producidas por cepas bacterianas previamente aisladas de composta.
http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/21661
Título: Inferencia de secuencias codificantes de enzimas proteolíticas producidas por cepas bacterianas previamente aisladas de composta.
Autor: Rivas Párraga, Roque Guillermo
Resumen: Thermostable proteases are very important for the improvement of industrial processes; however, few efforts have been made in prospecting new enzymes from microorganisms in Ecuador. This study aimed to identify proteolytic activity of thermophilic bacterial strains previously isolated from compost and infer the coding sequences of those enzymes through genomic and phenotypic characterization. Three isolates out of twenty-showed proteolytic activity at 55 °C, in LB media enriched with skimmed milk. The genetic diversity and phylogeny of the proteolytic-thermophilic bacterial strains were determined by analyzing 16S rRNA sequences. Bacterial strains were classified as closely related to Bacillus subtilis and Bacillus thermoamylovorans. Additionally, the whole genomes of two proteolytic strains were sequenced and annotated. We identified five coding sequences associated with extracellular proteases potentially responsible for enzymatic activities observed in the phenotypic assays: Minor extracellular protease (Epr), Extracellular metalloprotease (mpr), Minor extracellular protease (vpr), Bacilopeptidase F (bpr), and Neutral protease B (nprb).
Descripción: A pesar de la importancia de las proteasas termoestables para la mejora de los procesos industriales, se han realizado pocos esfuerzos en la prospección de nuevas enzimas a partir de microorganismos en Ecuador. El objetivo de este estudio fue identificar la actividad proteolítica de cepas bacterianas termófilas previamente aisladas de composta e inferir las secuencias codificantes de estas enzimas mediante una caracterización fenotípica y genómica. Tres aislados de un total de 20 mostraron actividad proteolítica a 55 ºC, en medio LB enriquecido con leche descremada. La diversidad genética y la filogenia de las cepas bacterianas con actividad proteolítica se determinó mediante el análisis de las secuencias del ARNr 16S. Dos cepas se clasificaron como estrechamente relacionadas con Bacillus subtilis y una con Bacillus thermoamylovorans. Adicionalmente, se secuenció y anotó el genoma completo de dos de las cepas con actividad proteolítica. En ellas se identificaron cinco secuencias codificantes relacionadas con enzimas proteolíticas extracelulares potencialmente responsables de la actividad enzimática observada en los ensayos fenotípicos: Proteasa extracelular menor (Epr), Metaloproteasa extracelular (mpr), Proteasa extracelular menor (vpr), Bacillopeptidasa F (bpr) y Proteasa neutral B (nprB).2021-05-31T00:00:00Z