Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/21661
Título: Inferencia de secuencias codificantes de enzimas proteolíticas producidas por cepas bacterianas previamente aisladas de composta.
Autor: Rivas Párraga, Roque Guillermo
Palabras clave: BIOTECNOLOGÍA
FILOGENIA
Fecha de publicación: 31-may-2021
Citación: Rivas Párraga, R. G. (2021). Inferencia de secuencias codificantes de enzimas proteolíticas producidas por cepas bacterianas previamente aisladas de composta. 30 hojas. Quito : EPN.
Resumen: Thermostable proteases are very important for the improvement of industrial processes; however, few efforts have been made in prospecting new enzymes from microorganisms in Ecuador. This study aimed to identify proteolytic activity of thermophilic bacterial strains previously isolated from compost and infer the coding sequences of those enzymes through genomic and phenotypic characterization. Three isolates out of twenty-showed proteolytic activity at 55 °C, in LB media enriched with skimmed milk. The genetic diversity and phylogeny of the proteolytic-thermophilic bacterial strains were determined by analyzing 16S rRNA sequences. Bacterial strains were classified as closely related to Bacillus subtilis and Bacillus thermoamylovorans. Additionally, the whole genomes of two proteolytic strains were sequenced and annotated. We identified five coding sequences associated with extracellular proteases potentially responsible for enzymatic activities observed in the phenotypic assays: Minor extracellular protease (Epr), Extracellular metalloprotease (mpr), Minor extracellular protease (vpr), Bacilopeptidase F (bpr), and Neutral protease B (nprb).
Descripción: A pesar de la importancia de las proteasas termoestables para la mejora de los procesos industriales, se han realizado pocos esfuerzos en la prospección de nuevas enzimas a partir de microorganismos en Ecuador. El objetivo de este estudio fue identificar la actividad proteolítica de cepas bacterianas termófilas previamente aisladas de composta e inferir las secuencias codificantes de estas enzimas mediante una caracterización fenotípica y genómica. Tres aislados de un total de 20 mostraron actividad proteolítica a 55 ºC, en medio LB enriquecido con leche descremada. La diversidad genética y la filogenia de las cepas bacterianas con actividad proteolítica se determinó mediante el análisis de las secuencias del ARNr 16S. Dos cepas se clasificaron como estrechamente relacionadas con Bacillus subtilis y una con Bacillus thermoamylovorans. Adicionalmente, se secuenció y anotó el genoma completo de dos de las cepas con actividad proteolítica. En ellas se identificaron cinco secuencias codificantes relacionadas con enzimas proteolíticas extracelulares potencialmente responsables de la actividad enzimática observada en los ensayos fenotípicos: Proteasa extracelular menor (Epr), Metaloproteasa extracelular (mpr), Proteasa extracelular menor (vpr), Bacillopeptidasa F (bpr) y Proteasa neutral B (nprB).
URI: http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/21661
Tipo: bachelorThesis
Aparece en las colecciones:Tesis Maestría en Biociencias aplicadas con mención en descubrimiento (FIQA)

Ficheros en este ítem:
Fichero Descripción TamañoFormato 
CD 11139.pdf1,38 MBAdobe PDFVisualizar/Abrir


Los ítems de DSpace están protegidos por copyright, con todos los derechos reservados, a menos que se indique lo contrario.