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Title: Desarrollo de un programa en matlab que permita el conteo de microorganismos en placas petrifilm utilizando visión computacional.
Authors: Montenegro Benavides, Jaime Mauricio
Keywords: PLACAS PETRIFILM
ALGORITMO K-MEANS
Issue Date: 16-Jul-2021
Publisher: Quito, 2021
Citation: Montenegro Benavides, J. M. (2021). Desarrollo de un programa en matlab que permita el conteo de microorganismos en placas petrifilm utilizando visión computacional. 107 hojas. Quito : EPN.
Abstract: Petrifilm Plates for counting and analyzing different types of microorganisms such as molds, yeasts and bacteria are a culture medium ready to use for research purposes in various fields of microbiology, their advantage is that they offer solutions through easy-to-use test. Fast and precise with reliable results that constitute quality indicators of the analyzed products. To interpret the information presented on the Plates, microbiologist use their sense of sight and a magnifying glass to improve visualization. Allowing them to count how many organisms exist on the Petrifilm Plates the count performed by the microbiologist it can present human errors because it depends on the senses of each person. To solve this problem, a software system was developed in Matlab that allows the automatic counting and analysis of microorganism in Petrifilm plates. The program includes: morphological operations, the k-means unsupervised learning technique, edge detectors and circular geometries, as well as identification of centers, areas and perimeters, as well as algorithms based on neighborhood and pixel connectivity that allow counting total of all microorganism present on the petrifilm plate. The development of this program is carried out on digital images of the petrifilm plates that were provided by the Department of Microbiology of the USFQ
Description: Las Placas Petrifilm para conteo y análisis de diferentes tipos de microorganismos como Mohos, Levaduras y bacterias son un medio de cultivo listo para usarse con fines investigativos en varios campos de la microbiología, su ventaja es que ofrecen soluciones a través de pruebas fáciles de usar, rápidas y precisas con resultados confiables que constituyen indicadores de calidad de los productos analizados. Para interpretar la información que se presenta en las Placas, los microbiólogos utilizan su sentido de la vista y un lente de aumento para mejorar la visualización, con lo cual, les permite contar cuantos organismos existen en las Placas Petrifilm, el conteo que realiza el microbiólogo puede presentar errores humanos debido a que depende de los sentidos de cada persona. Para solucionar este problema se desarrolló un sistema de software en Matlab que permite el conteo y análisis automático de microorganismos en placas Petrifilm. El programa incluye: operaciones morfológicas, la técnica de aprendizaje no supervisado k-means, detectores de bordes y geometrías circulares, así como también identificación de centros, áreas y perímetros, además algoritmos basados en vecindad y conectividad de pixeles que permiten realizar el conteo total de todos los microorganismos presentes en la placa petrifilm. El desarrollo del presente programa se efectúa sobre imágenes digitales de las placas petrifilm que fueron proporcionadas por el Departamento de Microbiología de la USFQ.
URI: http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/21736
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