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Title: Evaluación comparativa del desempeño computacional de la ejecución de consultas usando la base de datos Chembl
Authors: Molina Sierra, Samantha Penélope
Keywords: BENCHMARKING
BASES DE DATOS
DESARROLLO DE SOFTWARE
Issue Date: 5-Mar-2018
Publisher: Quito, 2018.
Citation: Molina Sierra, S. P. (2018). Evaluación comparativa del desempeño computacional de la ejecución de consultas usando la base de datos Chembl. 146 hojas. Quito : EPN.
Abstract: In the last twenty years the molecular information has been generated widely and expect it will grow according with the medical advances. Therefore, the bioinformatic should face some challenges such as: data storage, data processing and management of computational resources. These challenges can be exemplified in ChEMBL database, which is formed by 75 tables and the execution time of a query can take around thirty minutes. This is a problem and it is considered inefficient. Under the premise of improve the performance of this database two possible solutions have been proposed: (1) simplify the original data model according with the most relevant information, (2) adapt the simplify model to a new No SQL data model based on graphs. These two models were evaluated using a computational performance evaluation based on Capacity Planning.
Description: En los últimos veinte años, la cantidad de información de naturaleza molecular generada ha sido muy extensa y se espera que esta siga creciendo conforme aparezcan nuevos avances médicos. Por tanto, la bioinformática debe enfrentar varios desafíos tales como: almacenamiento de datos, procesamiento de datos y administración de recursos computacionales. Estos desafíos pueden verse ejemplificados en la base de datos ChEMBL que está conformada por 75 tablas y cuyas consultas pueden llegar a durar más de treinta minutos; lo cual se considera ineficiente. Bajo la premisa de mejorar el rendimiento de esta base de datos se han planteado dos posibles soluciones: (1) simplificar el modelo de datos original, considerando la información más relevante para este estudio, y (2) adaptar el modelo simplificado a un nuevo modelo de base de datos No SQL basado en grafos. Para evaluar los dos modelos, compararlos y elegir la mejor solución se ha realizado una evaluación de desempeño computacional usando la metodología Planificación de la Capacidad.
URI: http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/19271
Appears in Collections:Tesis Sistemas Informáticos y de Computación (ISIS)

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