Simulación computacional de modelos probabilísticos de evolución del ADN

Vargas Vivanco, Raquel Esthela

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Title:	Simulación computacional de modelos probabilísticos de evolución del ADN
Authors:	Vargas Vivanco, Raquel Esthela
Keywords:	ESTADÍSTICA CADENAS DE MARKOV R (LENGUAJE DE PROGRAMACION )
Issue Date:	13-Jul-2018
Publisher:	Quito, 2018.
Citation:	Vargas Vivanco, R. E. (2018). Simulación computacional de modelos probabilísticos de evolución del ADN. 136 hojas. Quito : EPN.
Abstract:	This work details the implementation of a program for simulating DNA sequences given a phylogenetic tree and a substitution model. It was implemented in R and generates matrices with DNA sequences of an arbitrary number of sites. A number of matrices were generated using different phylogenetic trees and substitution models which were used for Phylogenetic Tree Reconstructions. The goal was to study the behavior of the Maximum Likelihood Method for Phylogenetic Reconstruction.
Description:	En este trabajo se detalla la implementación de un programa que simula secuencias de ADN para un árbol filogenético y un modelo evolutivo dados. Fue implementado en lenguaje de programación R y permite generar matrices con secuencias de AND con un número arbitrario de sitios. Se generaron grupos de matrices utilizando distintos árboles filogenéticos y modelos evolutivos, las cuales fueron utilizadas en análisis de Reconstrucción de Árboles Filogenéticos con el objetivo de examinar el comportamiento del método de Reconstrucción Filogenética por Máxima Verosimilitud.
URI:	http://bibdigital.epn.edu.ec/handle/15000/19546
Type:	bachelorThesis
Appears in Collections:	Tesis Matemáticas (MAT)

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